西南大学近年来从创新党建工作机制着手，以健全理论学习机制为基础，健全民主管理机制为重点，健全组织建设为关键，健全育人机制为核心，全面推动学校党的建设，促进了学校各项事业的科学发展。
西南大学党委始终把思想理论建设摆在首要位置，从完善党委中心组学习制度、建立“一校两院”开展培训、完善理论宣讲制度三方面，创新理论学习机制。
完善学习制度，坚持理论学习经常性。健全了学校、学院两级党委中心组学习制度，中心组学习注重“三个结合”：理论学习与贯彻落实中央精神相结合，与研究学校当前中心工作相结合，与加强领导班子自身建设相结合，每次重点学习研究一两个专题，如2007年分别就学校战略发展规划、第一次党代会、本科教学评估等问题进行了专题研讨，提高了学习的实效性针对性。建立“一月两会”制度，每月一次党员组织生活会、一次政治学习会，每年开展一次读书月活动；坚持理论学习笔记本制度，保证了理论学习的经常化。积极推进马克思主义中国化最新成果“三进”工作，思想政治理论课成为青年学生理论学习的主渠道。
拓展教育阵地，突出理论教育针对性。依托“一校两院”开展培训：依托党校，开展党员干部培训；学校党校定期培训党务干部和拔尖人才，32个二级党校每年培训入党积极分子10000余人，培训预备党员和毕业生党员4000多人；依托培训学院，开展处级干部培训。开通了党建和思想政治工作网站――“青春缙云”，设置了理论学习、党团建设等栏目，定期策划党建热点问题讨论区，邀请领导、专家做客论坛，与师生进行在线交流。目前，“青春缙云”已成为全校师生学习理论的园地和交流思想的窗口。
开展理论宣讲和研究，增强理论教育实效性。学校党委成立了理论和“三个代表”重要思想宣讲团，坚持深入到校内外开展宣讲活动，受到了社会广泛好评。党的十七大召开以后，学校党委及时组建了专家和学生两支“十七大精神宣讲团”，到校内各单位巡回宣讲近百场，深受师生欢迎。加强理论研究，成立了党建理论研究会、党委理论调研组、马克思主义与思想政治教育研究中心、学生马克思主义研究会，在学院建立了党建与思想政治教育研究基地，定期举办理论研讨活动，每年有10余部理论著作出版，40余篇论文在核心刊物上发表。
学校党委以提高领导班子思想政治素质和办学治校能力为重点，建立健全领导班子建设和党内民主制度，发挥了党委在学校建设发展中的政治核心作用。
坚持并不断完善党委领导下的校长负责制。探索建立了党委领导、校长负责、教授治学、民主管理的管理运行机制。学校党委充分发挥政治核心和领导核心作用，把握方向，统揽全局，协调各方。
完善民主、科学的决策制度。学校党委认真贯彻民主集中制原则，坚持集体领导和分工负责相结合，重大问题会议决定。完善了党委常委会、校长办公会、学院党政联席会议制度，制定了党政工作规则和各种议事规则，规范了决策程序。建立重大决策征询制度，积极推进校务公开、院务公开，健全两级教代会制度，增强了决策的科学性和透明度，学校被评为“全国厂务公开”先进集体。
健全党内民主制度。一是认真执行《中国党员权利保障条例》，充分保障党员对学校重大事务的知情权、参与权。二是建立党务公开制度，坚持党内重大事务党员“三先”，即党员先知道、先讨论、先行动，完善了党内情况通报、定期听取党员意见等制度。三是扩大干部工作中的民主，民主测评、民主推荐、考察预告、任前公示、公开选拔、竞争上岗等成为学校选拔任用干部的必经程序。四是切实维护党员的民主选举权和表决权，在2007年学校第一次党代会和基层党组织选举中，扩大了候选人差额比例，候选人初始人由党员直接提名；发展党员实行三次公示，表决时实行“票决制”。五是加强党内民主监督，进一步完善了民主生活会、述职述廉、诫勉谈话等制度，首创干部廉政承诺制度；建立了民主评议领导干部制度，学校领导带头公开述职接受教代会评议，为加强对权力的制约和监督做出了表率。
学校党委始终坚持抓基层，打基础，建立健全基层党组织工作运行机制，激发内在活力，不断提高基层党组织的创造力、凝聚力和战斗力。
创新党组织设置，健全工作运行机制。学校党委根据新时期党建工作需要和基层党组织的具体情况，在荣昌校区和育才学院（独立学院）建立了党的工作委员会，在二级学院建立了党委，在直属单位设立了党总支。制定了《西南大学二级党组织工作条例》，在学院建立党政共同负责制，理顺了学院党组织的工作运行机制。坚持“支部划小、书记选好”的原则，按照“三个结合”，科学合理地设置党支部：坚持与学科建设相结合，把教师党支部建在系或研究所、学科团队；坚持与班级建设相结合，把本科学生党支部建在年级，高年级建在班上；坚持与培养教育相结合，把研究生党支部建在专业，形成了健全严密的组织网络，实现了党建工作重心的下移。为了有利于党支部开展工作，党委规定：教师党支部不超过20人，学生党支部不超过30人。加强对支部书记选拔工作，要求必须是具有两年以上党龄、符合条件的党员干部或教师。学校按每个党员100元的标准下拨党建工作经费，并要求学院每年预算党建工作专项经费，建立专门的党员活动阵地，为党组织活动经费和党建阵地提供了可靠保障，有力地推动了基层党组织建设，促进了党组织政治核心和战斗堡垒作用的发挥。
创新队伍建设机制，永葆党员先进性。学校党委进一步完善了发展党员工作制度，坚持以审查入党动机为重点，把好发展对象审批、预备党员审批、转正审批三个环节，推行公示制、问答制和票决制三项制度，发展党员质量不断提高，党员队伍结构不断优化。建立了教师党员发展“双培养”制度，努力将优秀青年教师培养成党员、将党员教师培养成教学科研骨干，近两年共有98名教师入党。积极创新党员教育管理机制，建立了党员“长期受教育，永葆先进性”的长效机制。对教师党员，坚持党性教育、师德建设、业务提高相结合，党员教职工在教书育人、管理育人、服务育人中发挥了骨干作用。对学生党员，注重入党积极分子、预备党员、毕业生党员教育相衔接，学生党员95%以上都是校级及以上各类表彰和奖学金获得者，充分体现了员的先进性。
学校坚持育人为本、德育为先，积极探索育人工作机制，形成了以学生党建工作为龙头，以优良学风建设为中心，以创新精神和实践能力培养为重点，以服务学校建设与发展、服务学生成长与成才为宗旨，促进学生成长成才的工作思路，完善了十大工作体系，构建了十大育人平台，有效地加强和改进了大学生思想政治教育，增强了思想政治教育的针对性实效性。
一是完善学生思想政治教育体系，构建理论育人平台。二是完善学生日常管理工作体系，构建制度育人平台。三是完善学生心理健康教育体系，构建心理育人平台。以“八个一”工程为载体，创建了“预防为主、迅速反应、重点突出、长期监控”的校园心理危机干预体系，构建了学校―学院―宿舍三级防护网络体系。四是完善学生帮困助学工作体系，构建真情育人平台。形成并完善了“奖、贷、勤、资、补、减、免”七位一体的多元化助学体系。五是完善学生生活园区工作体系，构建生活育人平台。建立了园区党建工作站和党员服务队，将园区拓展成为融“思想教育、素质拓展、文化娱乐、服务管理”为一体思想政治教育阵地。六是完善学生社会实践工作体系，构建实践育人平台。学校大学生社会实践连续20年被表彰为“全国大学生社会实践先进集体”。七是完善优良学风建设工作体系，构建导航育人平台。八是完善信息网络平台建设体系，构建阵地育人平台。一批红色健康网站受到了青年学生的青睐。十是完善学生工作队伍体系，构建组织育人平台。学校现有专职辅导员150余名，兼职辅导员110名，师生比为1:150。学校还建立了研究生辅导员队伍，加强了研究生思想政治教育。